История кафедры связана с именами Галихана Джантурина и Кенжекей Таскужиной, которые еще в советское время говорили о необходимости изучения отечественной истории. Пророческими стали слова Г.Джантурина: «Придет время и историю Казахстана будут изучать во всех учебных заведениях».
После распада СССР в декабре 1991 года начался процесс преобразования существовавших кафедр истории КПСС в кафедры истории Казахской ССР. В 1992 году Кустанайский педагогический институт им. 50-летия СССР был преобразован в Кустанайский государственный университет. С 1 сентября на историческом факультете КГУ стала функционировать кафедра истории и культуры Каз. ССР. Первым заведующим кафедрой был кандидат исторических наук, доцент Малик АльшуразовичАуган.
В сентябре 1994 года была образована кафедра истории Казахстана Костанайского сельскохозяйственного института во главе с доктором исторических наук, профессором А.Кузембайулы. На кафедре работали проф. Задорожный Г.К., доцент Мухаметов Ф., и другие. В связи со слиянием этого института с Костанайским государственным университетом в 1999 году одноименные кафедры объединились.
В разное время на кафедре работали доктора исторических наук, профессоры - З. Алдамжар, Г. Задорожный, кандидаты исторических наук, доценты К. Тасқожина, Қ. Дүтбаев, Ф. Мұхаметов, Ә. Мұқтар, Н. Жұмабаев, Л. Мұқатаева, С. Қолдыбаева, Ұ. Жанатаева, А. Айтмұхамбетов, Ұ. Ахметова, Л. Ордабаева, Г. Асанова.
Кафедра готовит высококвалифицированных кадров историков, а также обеспечивает преподавание истории Казахстана на неисторических специальностях.
Кафедра истории Казахстана обеспечивает изучение современной истории на первых курсах всех специальностей института.
На кафедре имеется вся необходимая учебно-методическая документация по всем формам обучения: государственные общеобязательные стандарты образования, типовые учебные планы, рабочие учебные планы, типовые, рабочие программы по дисциплинам, рабочие программы (силлабусы) по всем дисциплинам. Рабочие учебные планы по специальности «История» составлены в соответствии с типовыми учебными планами, включают в себя все дисциплины обязательного компонента, а также дисциплины компонента по выбору и по содержанию, соответствуют требованиям Государственного общеобязательного стандарта образования. Траектория обучения студентов выстроена последовательно и логично.
Преподаватели кафедры используют возможности своих дисциплин в воспитании казахстанского патриотизма, формировании активных жизненных позиций у студентов. Многие преподаватели, магистранты и студенты старших курсов активно принимают участие в общественной жизни института, города, области и республики. Выступают с лекциями перед населением, по областному радио и телевидению на страницах областных и центральных газет по актуальным проблемам истории Казахстана и современной политики.
Кафедра поддерживает связи со школами города Костаная и области. Преподаватели участвуют в различных мероприятиях, конференциях, олимпиадах в качестве жюри в школах города, лицеях и гимназиях.