Қазіргі кафедра 1959-1960 оқу жылынан бастау алады. Дәл сол кезде педагогикалық институтта Жаңа - бастауыш білім беру педагогикасы мен әдістемесі бөлімі ашылды. Келесі жылы ол Бастауыш оқыту әдістемесі факультеті (БОӘ) болып қайта құрылды. Оны Қостанайға белгілі педагог, үш орденнің кавалері, Қазақ КСР Халық ағарту ісінің үздігі, мұғалім, мектеп директоры, облыстық халыққа білім беру бөлімінің инспекторы, содан кейін мұғалімдерді жетілдіру Институтының директоры Б.Д. Мелехин басқарды.
2004 жылдан бастап кафедрада қазіргі Қазақстан үшін аса қажетті мамандық – мектепке дейінгі оқыту және тәрбиелеу қосылды. Біраз уақыттан кейін Кафедра "Педагогика және мектепке дейінгі, бастауыш және арнайы білім беру әдістемесі" деп аталды және осы мамандарды 2016 жылға дейін дайындады.
2016 жылдан бастап арнайы білім беру бағыты бөлініп, дербес кафедра мәртебесіне ие болды. Биылдан бастап кафедра бастауыш сынып мұғалімдері мен мектепке дейінгі ұйымдардың тәрбиешілерін сапалы даярлауды жүзеге асырады, "Мектепке дейінгі және бастауыш білім беру кафедрасы"деп аталады.
2019 жылы "Атамекен" ҚР Ұлттық Кәсіпкерлер Палатасы рейтингісінің қорытындысы бойынша Қазақстан Республикасының жоғары оқу орындары арасында "Бастауышта оқыту педагогикасы мен әдістемесі", "Мектепке дейінгі оқыту және тәрбиелеу" білім беру бағдарламалары тиісінше 1-ші және 2-ші орындарды иеленді.